В настоящее время вопрос экологии имеет очень важное значение, поэтому главной целью Внуково-3 в области охраны окружающей среды и рационального природопользования является снижение негативного техногенного воздействия и обеспечение экологической безопасности при осуществлении производственной деятельности. Для достижения поставленной цели разработан и внедрён комплекс природоохранных мероприятий, который соответствует всем требованиям экологического законодательства.
Во Внуково-3 соблюдаются законодательные и нормативные требования по предотвращению загрязнения окружающей среды, и ведется постоянная работа по улучшению деятельности в данном направлении.
Особое внимание уделяется вопросу сбора отходов после противообледенительной обработки воздушных судов. Тщательно отработанная технология сбора отходов противообледенительной жидкости с искусственных покрытий на секторе Внуково-3 дает эффективный результат.
Все проверки, проведенные Департаментом Росприроднадзора по Центральному федеральному округу в отношении комплекса Внуково-3, пройдены успешно.